| 中文标题 | 作者 | 论文ID | 分类简称 | 发布时间 |
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| 简化扩散模型忽略长程相互作用、自由能壁和地形崎岖，得到真实蛋白质相互作用速率 | Maximilian Schlosshauer and David Baker | q-bio/0401034 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 异二聚体肌动蛋白动力学及肌动蛋白的协同作用 | Ping Xie, Shuo-Xing Dou, Peng-Ye Wang | q-bio/0402018 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 接触位势能可可靠地预测蛋白质的稳定性吗？ | Jainab Kahtun, Sagar D. Khare, Nikolay V. Dokholyan | q-bio/0402039 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 细胞色素c中CD伸缩模式的振动能量弛豫（VER） | Hiroshi Fujisaki, Lintao Bu, and John E. Straub | q-bio/0403019 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 搜索两个弹性蛋白序列的低能构象 | H. Arkin | q-bio/0404005 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 杠杆臂和洗板势理论共同解释肌动蛋白II的动力学 | A. Buonocore, L. Caputo, E. Pirozzi and L. M. Ricciardi | q-bio/0404011 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 与疾病相关的蛋白质显示出带电残基之间增强的序列相关性 | Ruxandra I. Dima and D. Thirumalai | q-bio/0405006 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 拓扑热不稳定性与蛋白质长度 | R. Burioni, D.Cassi, F. Cecconi, A. Vulpiani | q-bio/0405010 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 接触矩阵和蛋白质中的疏水性特征的主要特征向量 | Ugo Bastolla, Markus Porto, H. Eduardo Roman, and Michele Vendruscolo | q-bio/0406003 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 蛋白质序列和结构中疏水性影响的解析 | Mehdi Yahyanejad, Christopher B. Burge, Mehran Kardar | q-bio/0406019 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 蛋白质构象识别的氨基酸替代矩阵 | Xin Liu, Wei-Mou Zheng | q-bio/0406032 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 非本地相互作用对蛋白质折叠速率的影响：理论与模拟 | C. Clementi and S. S. Plotkin | q-bio/0407023 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 为蛋白质设计开发最优非线性评分函数 | Changyu Hu, Xiang Li and Jie Liang | q-bio/0407040 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| HIV-1蛋白酶的折叠抑制剂设计 | R. A. Broglia, G. Tiana, D. Provasi, F. Simona, L. Sutto, F. Vasile and M. Zanotti | q-bio/0408013 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 利用正常模式探测蛋白质中的振动能量弛豫 | Hiroshi Fujisaki, Lintao Bu, John E. Straub | q-bio/0408023 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 丝氨酸-苏氨酸和酪氨酸蛋白激酶以及其他蛋白质家族的潜在周期性 | Andrew A. Laskin, Nikolai A. Kudryashov, Konstantin G.Skryabin, Eugene V. Korotkov | q-bio/0409008 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 酶作为热共振泵 | E. V. Korotkov | q-bio/0409009 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 小型α蛋白质的主要序列中的隐藏对称性 | Ruizhen Xu, Yanzhao Huang, Mingfen Li, Hanlin Chen, Yi Xiao | q-bio/0409014 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| FSSP到SCOP和CATH（F2CS）预测服务器 | Gad Getz, Alina Starovolsky and Eytan Domany | q-bio/0409017 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 水和分子伴侣作为蛋白质折叠网络的弱连接：能量景观和间断平衡变化指向蛋白质的博弈论 | Istvan A. Kovacs, Mate S. Szalay and Peter Csermely | q-bio/0409030 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 核小体和自由DNA的分子动力学模拟 | Thomas C. Bishop | q-bio/0410016 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 褶叠对双层插入不是必须的：一个具有明确脂质双层的α-螺旋肽的复制交换模拟 | Hugh Nymeyer, Thomas B. Woolf, and Angel E. Garcia | q-bio/0411001 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 戴奈因蛋白进行持续运动的模型 | Ping Xie, Shuo-Xing Dou, and Peng-Ye Wang | q-bio/0411023 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 存在外部负载下肌动蛋白II动力学的现象学模型 | A. Buonocore, L. Caputo, Y. Ishii, E. Pirozzi, T. Yanagida and L. M. Ricciardi | q-bio/0411025 | q-bio.BM | 2007-05-23 |
| 原生几何与蛋白质折叠动力学 | P.F.N. Faisca, M.M. Telo da Gama | q-bio/0411044 | q-bio.BM | 2007-05-23 |