蛋白质序列和结构中疏水性影响的解析

摘要:由于有间隔多变量高斯函数,我们将一组代表性蛋白质的溶剂可及性和疏水性分布的傅里叶变换进行拟合。这使我们能够将序列和结构分布的内在倾向与相关联的相互作用分开,例如,序列疏水性中的α-螺旋周期性由结构的溶剂可及性所决定。序列和结构分布的不同内在倾向在长周期上最为明显,其中序列疏水性波动更大,而溶剂可及性波动小于平均水平。有趣的是,两个分布之间的相关性可以解释为室温下溶剂化能的玻尔兹曼权重。

作者:Mehdi Yahyanejad, Christopher B. Burge, Mehran Kardar

论文ID:q-bio/0406019

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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