水和分子伴侣作为蛋白质折叠网络的弱连接:能量景观和间断平衡变化指向蛋白质的博弈论

摘要:水分子和分子伴侣能够有效地帮助蛋白质折叠过程。在这里,我们描述了它们在蛋白质的能量和拓扑网络中的作用。从能量角度来说,水和分子伴侣被认为能减少不同局部能量最小值之间的活化能,平滑能量景观,将错误折叠的蛋白质从构象陷阱中拯救出来,并稳定其天然结构。从动力学角度来说,水和分子伴侣可以使构象变化的阶段平衡不那么突兀,并有助于蛋白质松弛。最后,水和分子伴侣可以帮助蛋白质与大分子相互作用过程中多个能量景观的融合。我们还讨论了在蛋白质与另一种大分子结合时引入蛋白质游戏的可能性,以缩小能量景观的多样性。水和分子伴侣提供了一组弥散的、快速波动的弱连接(低亲和力和低概率相互作用),这使得所有这些说法都可以推广到多个网络中。

作者:Istvan A. Kovacs, Mate S. Szalay and Peter Csermely

论文ID:q-bio/0409030

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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