细胞色素c中CD伸缩模式的振动能量弛豫(VER)

摘要:评估振动能量弛豫速率(VER)的方法的回顾和应用于蛋白质细胞色素c中CD伸展模式的VER问题的理论结果。我们将细胞色素c在真空中建模为最低阶非线性耦合元素的正常模态系统。我们发现,对于“寿命”宽度参数$gamma=3 sim 30$ cm$^{-1}$,VER时间为$0.2 sim 0.3$ ps,与之前使用量子校正因子方法进行的经典计算非常吻合,并与Romesberg小组的光谱实验一致。我们将VER速率分解为两个模式的独立贡献,并发现“寿命”宽度参数取决于与CD振动模式最共振的那些模式的最显著贡献。

作者:Hiroshi Fujisaki, Lintao Bu, and John E. Straub

论文ID:q-bio/0403019

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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