| 中文标题 | 作者 | 论文ID | 分类简称 | 发布时间 |
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| 纳米粒子中核酸组分的分子结构与相互作用：从头计算 | Yu. V. Rubin, L. F. Belous | 1209.0985 | q-bio.BM | 2012-09-06 |
| β-桶膜蛋白中的链间配对模式：正外侧规则、芳香性拯救和链配对预测 | Ronald Jackups, Jr. and Jie Liang | q-bio/0601027 | q-bio.BM | 2012-08-27 |
| 蛋白质折叠和聚集模拟的氢键模型 | Marta Enciso | 1208.2177 | q-bio.BM | 2012-08-13 |
| 定量的DMS映射用于自动推断RNA的二级结构 | Pablo Cordero, Wipapat Kladwang, Christopher C. VanLang, Rhiju Das | 1207.1312 | q-bio.BM | 2012-07-06 |
| 四环素结构基药物的分类框架和结构活性关系（SAR） | Domenico Fuoco | 1111.2769 | q-bio.BM | 2012-06-13 |
| 离子通道，自然纳米阀门 | Bob Eisenberg | 1206.1253 | q-bio.BM | 2012-06-07 |
| 大肠杆菌DHFR酶催化循环中的构象选择和诱导性变化 | Thomas R. Weikl and David D. Boehr | 1205.2358 | q-bio.BM | 2012-05-11 |
| 蛋白质折叠：吉布斯自由能 | Yi Fang | 1202.1358 | q-bio.BM | 2012-04-10 |
| FMR1蛋白质的结构失序性评估与碳组成 | Baby Jerald A., T.R. Gopalakrishnan Nair, Ekambaram Rajasekaran | 1203.6721 | q-bio.BM | 2012-04-02 |
| 自发性（氨基酸含量）对称性破缺的显著新出现属性 | R.A. Broglia | 1203.3315 | q-bio.BM | 2012-03-16 |
| 蛋白质运动的快速模拟：融合柔性、刚性和正常模式分析 | J. E. Jimenez-Roldan and R. B. Freedman and R. A. R"omer and S. A. Wells | 1201.5531 | q-bio.BM | 2012-02-10 |
| 通道作为酶：悖论与同义反复 | Bob Eisenberg | 1112.2363 | q-bio.BM | 2011-12-23 |
| 无特异结合位点中丝氨酸蛋白酶蛋白质主链曲轴运动模型 | A. E. Sitnitsky | 1111.5468 | q-bio.BM | 2011-11-24 |
| 通过合理突变在石墨上控制自组装的肽 | Christopher R. So, Yuhei Hayamizu, Hilal Yazici, Carolyn Gresswell, Dmitriy Khatayevich, Candan Tamerler, and Mehmet Sarikaya | 1110.5622 | q-bio.BM | 2011-11-22 |
| 蛋白质非线性网络模型中的离散呼吸子 | Brice Juanico, Yves-Henri Sanejouand, Francesco Piazza, Paolo de los Rios | 0706.1017 | q-bio.BM | 2011-11-10 |
| 单个染色质纤维中正扭曲应力下的核小体手性转变 | Aurelien Bancaud, Gaudeline Wagner, Natalia Conde e Silva, Christophe Lavelle, Hua Wong, Julien Mozziconacci, Maria Barbi, Andrei Sivolob, Eric Le Cam, Liliane Mouawad, Jean-Louis Viovy, Jean-Marc Victor and Ariel Prunell | 0708.0156 | q-bio.BM | 2011-11-10 |
| 三螺旋捆绑蛋白的折叠机制的普适性和多样性 | Jae Shick Yang, Stefan Wallin, and Eugene Shakhnovich | 0708.0440 | q-bio.BM | 2011-11-10 |
| 古菌基于高离子强度条件下运行的微生物燃料电池 | Ximena C. Abrevaya, N.J. Saco, P.J.D. Mauas, E. Corton | 1109.6589 | q-bio.BM | 2011-09-30 |
| 蛋白质的多尺度组织结构通过图分割和鲁棒性分析：应用于肌球蛋白-肌球蛋白轻链相互作用 | Antoine Delmotte, Edward W Tate, Sophia N Yaliraki, Mauricio Barahona | 1109.4232 | q-bio.BM | 2011-09-21 |
| 蛋白质中由成对相互作用引起的接触矩阵性质 | Sanzo Miyazawa and Akira R. Kinjo | 0801.0365 | q-bio.BM | 2011-09-01 |
| 与顺铂相互作用导致DNA结构变化的分子动力学研究 | Alexander N. Issanin, Walter Langel and Patrick J. Bednarski | 1107.3921 | q-bio.BM | 2011-07-21 |
| 朊病毒的生物学 | Veronica Ines Cacace | 1106.3533 | q-bio.BM | 2011-06-20 |
| 蛋白质光折叠与量子折叠理论 | Liaofu Luo | 1105.2362 | q-bio.BM | 2011-05-13 |
| {alpha}-Bungarotoxin的表面可及性通过一种新型顺磁探针监测 | Andrea Bernini, Vincenzo Venditti, Ottavia Spiga, Filippo Prischi, Mauro Botta, Angela Pui-Ling Tong, Wing-Tak Wong and Neri Niccolai | 1105.0126 | q-bio.BM | 2011-05-03 |
| 生物聚合物结构能够用列举的方式进行抽样吗？一种逐步假设法实现原子精度的RNA环建模 | Parin Sripakdeevong, Wipapat Kladwang, Rhiju Das | 1104.5278 | q-bio.BM | 2011-04-29 |