蛋白质折叠：吉布斯自由能
摘要：蛋白质折叠的基本定律是热力学原理：蛋白质的氨基酸序列决定其原生结构，并且该原生结构具有最小的吉布斯自由能。如果所有化学问题都可以通过量子力学来解答，那么对于蛋白质的每个可能构象X，都应存在一个关于吉布斯自由能公式G(X)的量子力学推导。我们应用量子统计导出这样的公式。为简便起见，只涵盖了单体自折叠球形蛋白质。我们指出了公式的一些即时应用。我们展示了该公式非常好地解释了观察到的现象。它为折叠和变性提供了统一的解释；它解释了疏水效应为何是蛋白质折叠的驱动力以及氢键的作用；它解释了各种表面积模型的成功和缺陷。该公式还提供了折叠的清晰动力学力：Fi(X) = -ablaxi G(X)。这也为原位预测蛋白质结构提供了一种自然的方法，通过牛顿最快下降法将G(X)最小化。
作者：Yi Fang
论文ID：1202.1358
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2012-04-10