| 中文标题 | 作者 | 论文ID | 分类简称 | 发布时间 |
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| 温室世界的笔记：共同进化、行星可持续性和社区结构的研究 | Lee Worden | 0910.2526 | q-bio.PE | 2009-10-15 |
| 为什么生命诞生？ | Arto Annila and Erkki Annila | 0910.2621 | q-bio.PE | 2009-10-15 |
| 多物种随机模型：小RNA调控基因表达 | Vlad Elgart | 0910.2278 | q-bio.PE | 2009-10-14 |
| 用一个简单的尺寸结构模型理解森林动态和林地转换 | Tom Adams (1), Graeme Ackland (1), Glenn Marion (2), Colin Edwards (3) ((1) University of Edinburgh, (2) Biomathematics and Statistics Scotland, (3) Forest Research) | 0910.0387 | q-bio.PE | 2009-10-05 |
| 遗传密码演化的物理模型 | Tatsuro Yamashita and Osamu Narikiyo | 0901.0181 | q-bio.PE | 2009-09-30 |
| constNJ：一种满足成对拓扑约束条件的重建系统进化树集合的算法。 | Frederick A. Matsen | 0901.1598 | q-bio.PE | 2009-09-30 |
| 道路缓解措施对两栖动物种群的影响：一个阶段级种群数学模型 | Renaud Jolivet, Michel Antoniazza, Catherine Strehler-Perrin and Antoine Gander | 0806.4449 | q-bio.PE | 2009-09-29 |
| 具有常数去除感染者速率的流行病模型中的空间模式形成 | Quan-Xing Liu and Zhen Jin | q-bio/0610006 | q-bio.PE | 2009-09-29 |
| 突变积累的作用下的关键率 | Kenneth W. Wachter and David R. Steinsaltz and Steven N. Evans | 0808.3622 | q-bio.PE | 2009-08-27 |
| 简单生物系统的进化模型 | Franco Bagnoli | 0809.1231 | q-bio.PE | 2009-08-27 |
| 物种、聚类和“生命之树”：一个图论的观点 | Andreas Dress, Vincent Moulton, Mike Steel, Taoyang Wu | 0908.2885 | q-bio.PE | 2009-08-21 |
| 一个SIS-家庭-流行病模型的灭绝时间 | Tom Britton and Peter Neal | 0908.0408 | q-bio.PE | 2009-08-05 |
| 近原始珊瑚礁的鱼类生物量结构建模及钓捕造成的退化 | Abhinav Singh, Hao Wang, Wendy Morrison and Howard Weiss | 0809.5225 | q-bio.PE | 2009-07-30 |
| 种群动力学中的波动和扩散速率 | David A. Kessler and Leonard M. Sander | 0907.4386 | q-bio.PE | 2009-07-28 |
| 三碘甲状腺原氨酸抑制孵化中的母鸭（Somateria mollissima）体内的体液免疫，但不影响T细胞介导的免疫反应 | S. Bourgeon (DEPE-Iphc), T. Raclot (DEPE-Iphc) | q-bio/0703064 | q-bio.PE | 2009-07-24 |
| 单细胞生物中的二倍体和有性繁殖的选择性优势 | Maya Kleiman and Emmanuel Tannenbaum | 0901.1320 | q-bio.PE | 2009-07-17 |
| 重访系统发育学中最大简约法和最大似然法之间的等价性 | Mareike Fischer, Bhalchandra D. Thatte | 0808.3609 | q-bio.PE | 2009-07-06 |
| 最大简约法在分类单元子集上 | Mareike Fischer and Bhalchandra D. Thatte | 0809.3653 | q-bio.PE | 2009-07-06 |
| 受约束的Newman-Watts网络上的四态石头剪刀布游戏 | Guo-Yong Zhang, Yong Chen, Wei-Kai Qi, and Shao-Meng Qin | 0901.0955 | q-bio.PE | 2009-07-03 |
| 自然选择最大化费舍尔信息 | Steven A. Frank | 0901.3742 | q-bio.PE | 2009-06-18 |
| 表型空间中的进化博弈动力学 | Tibor Antal, Hisashi Ohtsuki, John Wakeley, Peter D. Taylor, Martin A. Nowak | 0806.2636 | q-bio.PE | 2009-06-04 |
| 某些食物网的局部动力学等价性 | Thilo Gross and Ulrike Feudel | 0906.0381 | q-bio.PE | 2009-06-03 |
| 多样性关系的根源 | Peter Wurtz and Arto Annila | 0906.0251 | q-bio.PE | 2009-06-02 |
| 计算机辅助疫苗设计 | Rao Zhou, Ramdas S. Pophale, and Michael W. Deem | 0904.4705 | q-bio.PE | 2009-05-28 |
| 具有多种策略的博弈中的突变选择平衡 | Tibor Antal, Arne Traulsen, Hisashi Ohtsuki, Corina E. Tarnita, Martin A. Nowak | 0811.2009 | q-bio.PE | 2009-05-16 |