酵母菌 S. cerevisiae 中转录调控的噪声过滤特征
摘要：转录调控主要受转录因子与DNA结合的特征和动态调控。这种动态调控中存在着随机效应，细胞功能位点的结合必须具有一定的特异性，以使得生物能够产生特定的细胞反应。特异性源于转录因子蛋白的结合亲和力和细胞丰度之间的相互作用，这些蛋白对于DNA的结合受其化学势的控制。 我们结合了酿酒酵母中的大规模蛋白质丰度数据和所有已知DNA结合位点序列的转录因子的结合亲和力，来评估它们的化学势行为。相当一部分转录因子显然非特异性地结合到DNA上，而观察到的丰度勉强足够确保高功能位点的占用。我们认为，这一特征的生物学原因与其噪声滤波效果有关：低于生理水平的丰度不能够使功能靶点显著结合，从而使得调控基因的错误表达得以控制。
作者：Erik Aurell, Aymeric Fouquier d'Herouel, Claes Malmnas, Massimo Vergassola
论文ID：q-bio/0703063
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23