基因冲浪
摘要:空间分辨率的遗传数据越来越多地被用于重建物种的迁移历史。为了辅助这种推断,我们通过模拟和分析方法研究了在一维中持续的区域扩张下中性基因频率的动态。在这样的殖民时期,血统可以通过“冲浪”机制在波前定性[Edmonds C.A.、Lillie A.S.和Cavalli-Sforza L.L. (2004 ) Proc Natl Acad Sci USA 101: 975-979]。我们通过衡量(i)到达定性的血统的空间分布,以及与之密切相关的(ii)在波前性状下遗失的遗传多样性(杂合度),以描述定性的方法来量化这一现象。我们的模拟结果显示,在控制了定殖过程中遗留下来的杂合度梯度的波中,可以分配有效种群大小。这种有效种群大小在推动波中明显高于拉动波,并且仅以亚线性增长与种群规模联系起来。为了解释这些和其他发现,我们开发了一个基于反应扩散系统物理的通用分析方法,可以得出任何确定性种群动态的简单预测。
作者:Oskar Hallatschek, David R. Nelson
论文ID:q-bio/0703040
分类:Populations and Evolution
分类简称:q-bio.PE
提交时间:2008-01-15