电荷静电相互作用在淀粉样β蛋白（Abeta）寡聚体形成中的作用：离散分子动力学研究
摘要：淀粉样蛋白（Abeta）的病理性折叠和寡聚体形成被广泛认为是阿尔茨海默病（AD）的核心。实验方法研究Abeta自组装存在问题，因为大多数相关聚集体是准稳定且不均匀的。我们应用离散分子动力学（DMD）方法结合四粒子蛋白模型研究了Abeta寡聚体的形成。我们讨论了两种最常见的Abeta异构体Abeta40和Abeta42之间的差异，在体外它们的寡聚化方式不同。我们研究了带电氨基酸对Abeta40和Abeta42寡聚体形成的影响。我们的结果表明，带电氨基酸促进了Abeta40和Abeta42的大型寡聚体的形成。Abeta40的大小分布保持单峰，而Abeta42的分布为三峰，与实验观察一致。Abeta42的折叠结构特征是C-末端的一个转弯，而Abeta40中不存在。我们显示了相同的C-末端区域也负责Abeta42五聚体和更大寡聚体中最强的分子间接触。我们的结果表明，这个C-末端区域在Abeta42寡聚体的形成中起着关键作用，并且在带电氨基酸存在时，这个区域的重要性增加。这些结果表明，靶向Abeta42寡聚体的C-末端区域的抑制剂可能能够阻止寡聚体的形成或者结构上改变聚集体以减少其毒性。
作者：Sijung Yun, Brigita Urbanc, Luis Cruz, Gal Bitan, David B. Teplow, and H. Eugene Stanley
论文ID：q-bio/0701037
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-13