RNA中性网络进化搜索中的新结构变异
摘要：RNA二级结构是一个重要的计算模型，用于理解基因变异如何映射到表型（结构）变异。RNA结构中的进化创新是通过中性网络来实现的，这是一组大的连接的RNA序列，可以折叠成相同的结构。我们的工作扩展和深化了以前对中性网络的研究。首先，我们表明即使是给定序列（基因型）G0的1-变异邻域，其包含许多与P不接近的结构变体。这适用于生物和通用RNA序列。其次，我们分析了与距离G0相对较远（海明距离k）的基因型Gk的1-邻域中的新结构与G0本身的结构之间的关系，对于生物和通用的RNA结构都适用。第三，我们分析了序列的突变稳定性与接近该序列的结构变体之间的距离之间的关系。我们的发现强调了中性网络在进化创新中的作用，以及高稳健性在减少此类创新潜力中可能发挥的作用。
作者：Sumedha, Olivier C Martin and Andreas Wagner
论文ID：q-bio/0612028
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2008-01-22