铵化银染色提高了质谱兼容性
摘要：蛋白酶消化产生的肽段在质谱分析中的序列覆盖是对蛋白质进行详细表征或在较低浓度下进行鉴定的关键问题。在凝胶基质蛋白质组学研究中，序列覆盖很大程度上取决于蛋白质检测方法。本研究表明，使用氨的银探测方法在保持高灵敏度的同时，提供了比标准硝酸银方法更好的序列覆盖。随着基于二维凝胶电泳的蛋白质组学的发展，对用于在2D凝胶上检测蛋白质的检测方法产生了另一个负担。除了从一个蛋白质到另一个蛋白质的线性性，灵敏度和均匀性的传统要求外，检测方法现在还必须考虑另一个方面，即它们与质谱的兼容性。质谱的兼容性通过两个不同且互补的方面得到证明：一是从凝胶中检测并消化的蛋白质消化产生的肽段上不存在加合物和人为修饰，二是通过质谱仪分析后所恢复的肽段的定量收率。虽然这种定量收率本身并不重要，但它是一个关键参数，因为它强烈影响质谱的信噪比，从而影响从给定蛋白质输入中可以检测到的肽段数量，特别是在蛋白质含量较低的情况下。这反过来又影响了序列覆盖和质谱仪提供的分析细节。
作者：Mireille Chevallet, H''el`ene Diemer (IPHC), Sylvie Luche, Alain van Dorsselaer (IPHC), Thierry Rabilloud, Emmanuelle Leize-Wagner (IPHC)
论文ID：q-bio/0611083
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2016-08-16