剪接位点的遗传变异

摘要:剪接位点在人类基因组中提供了独特的统计数据,由于它们的数量众多并且被相对完整地注释。对剪接位点中累积的SNP分布进行分析揭示了一些有趣的观察结果。尽管核苷酸保守性程度会对SNP密度产生单调的影响,但在SNP频率谱中并没有发现明显的变化。半保守的核苷酸位点主要包含过渡突变。我们认为,这种过渡偏好是由位点与相应结合因子的共同进化引起的。由于在人类和其他生物中,过渡突变几乎是转换突变的两倍频率,这种适应性显著降低了突变负荷。

作者:Dmitri Parkhomchuk

论文ID:q-bio/0611060

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2007-05-23

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