二核苷酸熵作为基因组序列功能的衡量指标
摘要：基因组浏览器中，GC含量被发现在功能性较强的区域更高。该研究表明，二核苷酸和三核苷酸分布的熵提供了对基因组序列功能性的更优衡量方式，并对为什么GC含量必须升高（接近50\%）在功能区域中提出了解释。高熵区域与外显子强烈共定位，并提供了全基因组范围内关于保守选择对非编码区域的证据，如较低的SNP密度。这些观察结果表明，功能性非编码区域被优化以适应突变负荷，使得转换突变对功能性的影响小于颠换突变，从而导致功能区域中颠换突变转换的比率降低。
作者：Dmitri Parkhomchuk
论文ID：q-bio/0611059
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23