真核生物需要多少非编码DNA?
摘要:通过对37个完全测序的真核基因组的观察,我们发现真核生物需要一定数量的非编码DNA(ncDNA)。这个最低数量与外显子中的DNA数量呈二次正相关。根据一种简单的调控网络生长模型,我们推导出了对ncDNA所需数量的理论预测,并发现与实际数据非常吻合。真核生物所需的附加ncDNA(以碱基对计)遵循Ndef = 1/2(Nc / Np)(Nc - Np)的规律,其中Nc表示外显子DNA的数量,Np是一个约为10Mb的常数。在人类和其他哺乳动物中,这个值Ndef对应着基因组的几个百分点,在较简单的真核生物中则可能达到基因组的一半。因此,我们的研究结果证实了真核生物的生命依赖于大量的ncDNA,并且对这部分基因组的大小进行了准确的预测。
作者:Sebastian Ahnert, Thomas Fink, Andrei Zinovyev
论文ID:q-bio/0611047
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2008-02-05