异质细胞群体动态：无方程不确定性量化计算
摘要：领接异质生物振荡器总体动力学的计算方法: 一种计算方法，用于建模耦合异质生物振荡器总体动力学。与蒙特卡罗模拟相比，该方法利用广义多项式混沌（gPC）来表示总体的随机特性，从而将振荡器集合的动力学降低为（通常较少的）代表性gPC系数的动力学。无方程（EF）方法用于高效地演化这些gPC系数，并计算它们的粗粒化稳态和/或极限周期解，从而避免推导明确的闭式演化方程。可以很容易地从这些gPC系数重构振荡器的集合实现和统计信息。我们将这种方法应用于通过细胞内代谢物的膜交换耦合的酵母糖酵解振荡器的同步。异质性包括一个随机参数，该参数反映了葡萄糖流入细胞，该参数在群体中服从高斯分布。粗粒化投影积分用于加速群体统计的演化。粗粒化的固定点算法结合Poincaré回归映射用于计算细胞群体的振荡解并量化其稳定性。
作者：Katherine A. Bold, Yu Zou, Ioannis G. Kevrekidis, and Michael A. Henson
论文ID：q-bio/0611001
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2007-05-23