新不变量方法在均匀和非均匀四元树上的性能
摘要：使用系统发育不变量进行树重建的尝试始于80年代末和90年代初，由几位作者（最初的想法来自Lake和Cavender和Felsenstein在1987年的研究）。然而，基于不变量的方法的效率仍然存在疑问，可能是因为这些方法只使用了系统发育不变量集合中的少量生成器。本文研究的方法首次由Casanellas，Garcia和Sullivant引入，这是第一个基于不变量且利用整个生成器集合进行DNA数据分析的方法。本文中进行的模拟研究证明了该方法是一种非常竞争和高效的系统发育重建方法，尤其适用于非均匀模型的系统发育树。
作者：Marta Casanellas, Jesus Fernandez-Sanchez
论文ID：q-bio/0610030
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-05-23