系统生物学中的马尔可夫模型家族树
摘要：基于马尔可夫过程的概率框架来表示细胞内过程，旨在解决系统生物学的应用问题。本文回顾了系统生物学文献中不同随机模型之间的形式关系。作为回顾的一部分，我们提出了一种新颖的推导方法，用于描述由连续和跳跃过程组成的一般多维马尔可夫过程的微分查普曼-科尔莫哥洛夫方程。我们从概率密度的时间导数定义开始，不限制概率分布的范围，特别是不假设其局限于概率为零的区域上。在我们的推导中，主方程给出了马尔可夫过程的跳跃部分，而福克-普朗克方程给出了连续部分。我们在系统生物学的随机模型中勾画了一个“家族树”，提供了它们之间形式关系的显式推导，并澄清了所涉及的假设。
作者：Mukhtar Ullah and Olaf Wolkenhauer
论文ID：q-bio/0610003
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2007-08-13