结构相似性增强蛋白质间相互作用倾向
摘要：相互作用蛋白样表面的统计性质及其预测的两个相关效应：(i) 蛋白质的统计增强自吸引作用；(ii) 与具有类似结构的蛋白质的统计增强吸引作用。这些效应源自于一个事实，即在两个相同的，甚至是随机组织的相互作用蛋白样表面之间找到自我匹配模式的概率总是比两个不同的，多样化的蛋白质表面之间找到模式匹配的概率高。这个理论发现解释了之前报道的蛋白质-蛋白质相互作用网络中同源二聚体的统计优势。此外，我们通过对蛋白质复合物的精选数据库的分析来证实了我们的发现，结果显示结构相似、序列高度分歧的蛋白质形成的二聚体存在非常显著的统计过表示。我们预测，相当一部分异源二聚体是通过对多样二聚体形成进行负向设计的进化压力演化而来的。这是通过特定的带电残基之间的高度特异性接触的形成来实现的，这在模型和真实的超家族异源二聚体中都得到了证实。
作者：D. B. Lukatsky, B. E. Shakhnovich, J. Mintseris, E. I. Shakhnovich
论文ID：q-bio/0609048
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-05-23