基因长度分布在基因组中的建模

摘要:基因长度的特定分布可能是自然基因组中观察到的生长过程的结果,其中单一长度尺度$L(t)$随时间按$t^{1/3}$增长。这个长度尺度可能与进化基因组中最长基因的长度有关。基因的生长动力学类似于保持有序参数的物理系统中观察到的动力学。我们显示,在基因组中,这种保持由基因引入的嘌呤趋势沿DNA链的组成补偿所保证。所提出的数学模型是应用于一维$N$自旋系统的临界自组织的修改的Bak-Sneppen模型。自旋取离散值,代表基因的长度。

作者:S. Cebrat, M.R. Dudek, P. Mackiewicz

论文ID:q-bio/0607029

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2007-05-23

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