人类21号染色体中与结构相关的DNA序列特征的大规模振荡
摘要：人类染色体21是人类基因组中唯一表现(G+C)含量振荡的染色体，振荡周期为几百千碱基（在右端端粒附近为500 kb）。我们的目标是确定在结构相关的序列特征中是否存在类似的周期性，以将这种(G+C)\%振荡与其他生物现象联系起来。以下数量在人类染色体21中展示了与500 kb周期相同的振荡：通过两组二核苷酸基于热力学参数计算出的结合能量、AA/TT和AAA/TTT生物/三核苷酸密度、5'-TA-3'二核苷酸密度，以及AA/TT或AAA/TTT的10/11碱基周期性信号。这些固有的数量与DNA双螺旋分子的结构特征相关，如碱基配对结合、解旋/解缠、刚性和核小体形成的一种倾向。
作者：Wentian Li and Pedro Miramontes
论文ID：q-bio/0606016
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23