蛋白质结构预测:下一代

摘要:蛋白质折叠化学反应的统计力学研究已经形成了一个普遍的理解。基于能量景观理论的蛋白质折叠动力学研究的经验为蛋白质结构预测,特别是粗粒化模型的发展带来了益处。我们对盲结构预测的结果进行了调查。我们探索如何通过引入先前模拟结构的集合信息来开发第二代预测能量函数。该过程依赖于一个漏斗状能量景观的假设,符合最小困扰原则。与基于序列比对选择的实验蛋白质结构相比,第一代模拟结构为关联记忆能量函数提供了改进的输入。

作者:Michael C. Prentiss, Corey Hardin, Michael P. Eastwood, Chenghong Zong, Peter G. Wolynes

论文ID:q-bio/0606012

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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