肌动蛋白马达结构改变及核苷酸解离

摘要:从前动力肌动蛋白分子领域到近接杂交状态的结构松弛,我们使用了一种粗粒化蛋白质模型的分子动力学模拟方法进行了研究。为了描述结构的变化,我们提出了一种“双重Go模型”,这是一种具有两个参考结构的Go-like模型的变种。我们还通过引入粗粒化核苷酸在模拟中来研究核苷酸的离解过程。我们发现,在核苷酸离解之前,肌动蛋白结构向近接杂交构型的松弛过程无法完成。此外,当核苷酸与肌动蛋白头部紧密结合时,松弛和离解是协同发生的。结果表明,核苷酸的主要作用是抑制结构松弛。

作者:Fumiko Takagi, Macoto Kikuchi

论文ID:q-bio/0605031

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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