肽和蛋白质中的振动能量弛豫和去相干的时间相关微扰理论

摘要:提取的公式和解相同的内容是非马尔可夫描述下的振动能量弛豫和去相干的公式,并使用时间相关的微扰理论。为了零阶近似,我们采用了一种正常模式观点,系统-浴哈密顿量包含了大于三阶的耦合项。当我们采用马尔可夫近似时,我们的理论简化为Maradudin-Fein公式,用于描述玻璃和蛋白质的振动能量弛豫性质。当系统的非谐性和环境的重整化效应消失时,我们的公式简化为Mikami和Okazaki使用路径积分影响泛函方法导出的公式。我们将我们的公式应用于重水中类似小氨基酸分子N-甲基乙酰胺的酰胺I模式的振动能量弛豫。

作者:Hiroshi Fujisaki, Yong Zhang, John E. Straub

论文ID:q-bio/0601034

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2009-11-13

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