好和坏折叠蛋白的热力学特征:来自简化离格蛋白模型的结果

摘要:小型SH3蛋白质结构域的热力学性质研究,采用简化模型,其中每个珠状氨基酸通过由20x20随机矩阵控制的接触势相互作用。具有良好折叠序列的蛋白结构在热力学上显示出三个主要相,即类似线圈的相、未折叠的小球状结构和折叠相(还有两个相,即仅在极端温度下出现的冻结相和随机线圈相)。有趣的是,未折叠的小球状结构已经具有一些部分结构化区域。另一方面,设计不良的序列从随机线圈到冻结态的转变很宽。还讨论了与异聚物的分析理论的比较。

作者:A. Amatori, J.Ferkinghoff-Borg, G. Tiana, and R. A. Broglia

论文ID:q-bio/0512029

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2009-11-11

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