果蝇中聚合酶依赖染色体相互作用的建模和模拟
摘要：Rabl配置中核内染色体的条件已被建模为受限制条件下的自避免聚合物链。为了确保染色体保持伸展并排列整齐，我们将其末端固定在两个相对的墙上。段数$N$，固定点之间的距离$d\_1$和$d\_2$，以及墙壁之间的距离$z$（以段长度测量）确定了Kuhn段长度$k\_l$的近似值。我们使用分子动力学模拟染色体的运动，以获取在没有进一步的吸引或排斥力的情况下遗传位点之间的预期距离分布。与对果蝇Melanogaster的生物实验进行比较，可以获得我们模型的参数信息。通过正确的参数，可以得出关于导致配对的吸引力的强度和范围的结论。
作者：S. Ritter, J. Odenheimer, D. W. Heermann, F. Bantignies, C. Grimaud, G. Cavalli
论文ID：q-bio/0511008
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2007-05-23