病毒壳体组装的动态途径
摘要:通过牛顿动力学模拟,我们开发了一类模型,用于模拟颗粒组装成T1壳体样物体的过程。通过对系统参数进行多次不同取值的模拟组装,我们可以改变驱动组装的力。在某些参数范围内,组装很容易进行,而在其他情况下,组装受到动力学陷阱的阻碍,使得形态不正常或者壳体形成不完整。我们的模拟对各种不同浓度下的壳聚体进行了多个独立轨迹的采样,从而得出统计学上有意义的结论。根据亚单位(即壳聚体)的几何形状,成功的组装可以通过多种机制进行,包括中间体的不同大小的结合。我们讨论了这些机制与实验评估壳体组装过程之间的关系。
作者:Michael F. Hagan and David Chandler
论文ID:q-bio/0511006
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-11-11