溶剂和突变对淀粉样β-蛋白折叠的成核影响
摘要：抑制A$eta$的病理性折叠和寡聚体化可能在防治AD中有效。本研究使用全原子分子动力学模拟在明确的溶剂环境中探索了A$eta$的一段十肽片段A$eta\_{21-30}$的初始折叠阶段，该片段已被实验证明引发了折叠过程。此外，我们还研究了一个类似的含有氨基酸替代的十肽谷氨酰胺替代物，与遗传性脑出血相关的淀粉样变性-荷兰型，[Gln22]A$eta\_{21-30}$。我们发现：（i）当十肽在水中时，疏水作用和Lys28与Glu22或Asp23之间的瞬时盐桥对于形成Val24-Lys28区域的环是重要的；（ii）在存在盐离子的情况下，盐桥在稳定环中起到更为重要的作用；（iii）在密度降低的水中，十肽形成螺旋结构，表明折叠对不同水环境的敏感性；（iv）与野生型肽相比，"荷兰"肽在水中不能形成长寿命的Val24-Lys28环，这表明环的稳定性是决定A$eta$是否折叠成病理结构的关键因素。我们的结果有助于理解A$eta$肽在不同环境中(如细胞内外环境或细胞膜)的折叠机制，以及与遗传性淀粉样变性相关的氨基酸替代如何导致疾病。
作者：Luis Cruz, Brigita Urbanc, Jose M. Borreguero, Noel D. Lazo, David B. Teplow and H. Eugene Stanley
论文ID：q-bio/0510048
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-11