扩展随机化系统中长程相关性的普适性
摘要：基因组DNA的进化中的非平衡1D扩张-随机化系统的普适性类是通过单引位突变、分段重复、删除和随机插入演化的序列的随机动力学研究。在序列长度增长的范围内，这些过程与基因组DNA的进化相关，并定义了一个具有长程普遍相关性的非平衡1D扩张-随机化系统的普适性类。我们明确得到了序列组成的两点相关函数和有限长度序列中组成偏差的分布函数。这些数量的特征指数$chi$由两个有效速率的比率决定，这些速率在普适性类的几种特定序列演化动力学中明确计算。根据$chi$的值，我们发现了两个不同的缩放区域，这两个区域能够通过初始组成偏差的可检测性来区分。所有分析结果都已通过数值模拟进行了准确验证。我们还讨论了相关性的非平稳建立和衰变，以及更复杂的进化情景，其中过程的速率随时间变化。我们的研究结果为分子生物学中普适性的出现提供了一个可能的例子。
作者：Philipp W. Messer, Michael Lassig, Peter F. Arndt
论文ID：q-bio/0509027
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2009-11-11