高分辨率蛋白质折叠的可转移势
摘要：用一种广义的计算方法，结合可传递的势能和几何真实的全原子模型，对七种不同的螺旋束蛋白进行了折叠。该协议通过对折叠构象集合的图论分析进行了系统应用，并且在不知道原生态的情况下持续地产生了3埃的结构预测。为了测量和理解结果的重要性，进行了大量的对照模拟。图论分析为系统地识别出原生折叠提供了方法，并提供了物理洞察力，将结果与现代蛋白质折叠理论观点概念上联系起来。除了提供一种预测结构和折叠机制的方法外，我们的模型还暗示，准确的全原子氨基酸表示结合合理的原子间相互作用势（不需要优化测试集）和氢键是实现真实蛋白质模型的关键特征。
作者：Isaac A. Hubner, Eric J. Deeds, and Eugene I. Shakhnovich
论文ID：q-bio/0509007
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-11