构建具有局部对称轴的二十面体颗粒的工具包
摘要：三维粒子的局部对称轴的位置可以通过一种形式主义来确定，该主义基于非晶态Coxeter群H\_3的根系编码生成离散旋转对称性的反射平面的位置。通过对根系进行适当扩展，引入了确定局部旋转对称轴的新的反射平面。导出了一种易于实施的形式主义，可以计算具有局部对称性的任何三维二十面体颗粒的表面结构。在与相应反射群的根系结合使用时，该方法也可用于具有总体八面体和四面体对称性的颗粒。 讨论了对病毒的应用。显示出在Caspar-Klug理论中，准等价概念对应于该处理论中所包含的局部六重对称轴的特殊情况，并且相应的几何图形可以通过基于H\_3的根系的形式主义得到。 此外，作为副产品，该理论回答了长期存在的开放问题，即为什么只观察到某些类型的头壳蛋白亚基簇在病毒的表面结构中。由于头壳亚基的类型由它们所处的局部对称轴的阶数决定，因此根据该理论允许的局部对称轴的频谱限制了可能出现在病毒壳的所有亚基类型。根据此，我们确定了可能出现在病毒壳中的所有亚基类型的频谱，并给出了较低阶的具体示例。
作者：Reidun Twarock
论文ID：q-bio/0508015
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-05-23