双链形成的碱基配对模型I：Watson-Crick配对几何
摘要：寡核苷酸双链形成的碱基配对模型及其与最近邻二聚体方法的等效性：对只含有Watson Crick对的短DNA-DNA和DNA-RNA杂交体系的双链形成自由能拟合数据进行详细分析。该方法将聚合物的秩缺陷与决定秩的寡核苷酸参数集之间的联系变得清晰透明。该方法推广到包括RNA/DNA杂交体系，其中秩缺陷模型具有11个二聚体参数，实际上相对于具有16个独立二聚体参数的标准方法，提供了稍微更好的预测结果（$\Delta G$的平均误差分别为4.5和5.4\%）。
作者：J.D. Bashford and P.D. Jarvis
论文ID：q-bio/0507041
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-05-23