细菌基因组中的阴谋
摘要：123种细菌的密码子使用频率的排序分布最适合一个三个参数函数，该函数是一个常数、一个指数项和一个线性项在排名n上的和。参数依赖于（二次抛物线）总的GC含量。氨基酸的排序分布适合一条直线。所有密码子的香农熵在GC含量上呈现出一个抛物线，而在密码子子集上计算的偏熵表现出不同的行为，从而展示了第一个共谋效应。此外，特定集合上的密码子使用频率之和，如以C和A（分别为G和U）作为第i个核苷酸，与GC含量呈现出明显的线性关系，展示了另一个共谋效应。
作者：Luc Frappat, Antonino Sciarrino
论文ID：q-bio/0507030
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2009-11-11