粗粒化蛋白质动力学模型中的异构作用
摘要:精化的弹性网络模型(ENM)的优化参数选择标准及其应用于牛胰蛋白酶原。牛胰蛋白酶原的ENM显示单峰的态密度分布,与全原子模型得到的双峰分布不符。然而,通过增强相邻骨架原子之间的相互作用,可以恢复出双峰分布。我们使用增强的模型来分析胰蛋白酶原的变构机制,并发现调控位点和活性位点之间存在较强的通信。
作者:Dengming Ming (1), Michael Wall (1) ((1) Los Alamos National Laboratory)
论文ID:q-bio/0506031
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-09-29