若干单倍型问题的复杂性研究
摘要:关于单倍型分析的一系列结果 从不完整和/或不完美的序列单倍型数据中重构单倍型的组合问题是困难的,是NP-hard的,并且在关于相关问题的先前声明中指出了问题,并提出了一个多项式时间算法来解决最长单倍型重建的未缺失情况。其次,我们提出了一个多项式时间算法,用尽可能少的单倍型解决基因型数据的问题(纯最简单单倍型问题,PPH),其中每个基因型最多有两个不确定位置,从而解决了Lancia等人在“通过纯最简单单倍型表示进行人群单倍型分析:精确和近似算法的复杂性”中提出的一个悬而未决的问题。
作者:Rudi Cilibrasi, Leo van Iersel, Steven Kelk, John Tromp
论文ID:q-bio/0505023
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2007-05-23