在萨尔加索海中的媚米病毒亲属
摘要：Acanthamoeba polyphaga Mimivirus（多刺阿姆伯多埃巴迷你病毒）的发现和基因组分析，改变了关于病毒的许多传统观念。其粒子大小（>400 nm），基因组长度（1.2百万bp）和庞大的基因组（911个编码蛋白基因）模糊了病毒和最小寄生细胞有机体之间已有的界限。系统发生分析还表明，迷你巨病毒的血统可能在细胞有机体三个已确定的领域个体化之前就已经出现，这引发了一场只有通过产生和分析更多数据才能解决的争论。下一步是寻找迷你巨病毒不是其种类的唯一代表的一些证据，并确定在何处寻找新的迷你巨病毒。对所有迷你巨病毒预测蛋白进行详尽的相似性搜索，并与所有公开可用的序列进行比对，发现它们的最近同源物主要集中在Sargasso Sea环境序列中。随后的系统发生分析表明，在Sargasso Sea中存在数量丰富的未知大型病毒，与迷你巨病毒的亲缘关系比任何目前已鉴定的物种更近。通过其的分离和基因组测序，可能有助于理解大型DNA病毒的起源和多样性，并对它们在真核生物的出现中发挥的作用有所了解。
作者：Elodie Ghedin, Jean-Michel Claverie (IGS)
论文ID：q-bio/0504014
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-05-23