碱基对相互作用和杂交等温线在微阵列上的匹配和不匹配寡核苷酸探针

摘要:使用显微结合模型以及平均杂交等温线和单碱基相关的亲和力项,我们分析了完全匹配(PM)和不匹配(MM)探针的信号强度与浓度的依赖关系。通过对PM和MM探针的信号强度及其差异进行评估,我们考察了它们对基因表达测量的敏感性、特异性和分辨率。所提出的理论暗示着对探针水平分析的现有算法进行改进,以纠正微阵列数据的非特异背景强度。

作者:Hans Binder, Stephan Preibisch, Toralf Kirsten

论文ID:q-bio/0501008

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-05-23

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