蛋白质结构字母表及其替代矩阵CLESUM
摘要：使用混合模型对由四个连续残基的$C_\alpha$原子形成的三个伪键角的密度分布进行建模，将蛋白质的局部结构状态离散化为一个由17个构象字母组成的蛋白质结构字母表的序列。通过这种粗粒化过程，将三维结构转化为一维编码序列。基于FSSP数据库的结构比对，构建了这些字母之间的替代矩阵。
作者：Wei-Mou Zheng, Xin Liu
论文ID：q-bio/0412046
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-05-23