基因组中的分歧与香农信息
摘要:DNA序列的Shannon信息(SI)及其特例多样性是以序列中化学词的概率为基础定义的,并对一组长度和组成高度多样的完整基因组进行计算。我们发现以下内容:对于随机序列,SI(但不是多样性)与序列长度成反比关系,但对于基因组来说是与长度无关的;基因组SI始终比随机序列中那些与基因组的长度和组成相匹配的序列的SI更大,并且对于更短的词和更长的序列,基因组SI要比其高几百到几千倍;基因组SI似乎具有词长依赖的通用值。这种普遍性被推断为基因组生长的一个普遍模式的进化遗迹。
作者:Hong-Da Chen, Chang-Heng Chang, Li-Ching Hsieh and Hoong-Chien Lee
论文ID:q-bio/0412037
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2009-11-10