在无链偏置替代模型中强制可逆性允许从DNA序列比较中理论上和实际上识别出其五个参数
摘要：DNA中的碱基配对规则导致DNA在进化过程中经历的一些突变会导致相同的替代，因为我们只能观察到耦合的核苷酸之间的差异。因此，在两条DNA链之间没有偏差的情况下，一个具有最多6个不同参数的模型就足以研究源自共同祖先的同源序列之间的进化关系。另一方面，相同的对称性减少了可以进行的独立观察数量。这种减少有时会使参数的计算无效。为了在可接受的生物学假设和可行性之间寻找一个折中，提出了一个具有五个参数的可逆的无链偏差条件（RNSB）。通过示例展示了该模型下参数的可识别性。
作者：O. Zagordi, J. R. Lobry
论文ID：q-bio/0412028
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-05-23