肽的折叠热力学

摘要:蛋白质折叠研究中的原子水平简化相互作用势模型在一组大约含有20个残基的多肽上进行了讨论和测试。测试集包含了α-螺旋(Trp cage, Fs)和β-折叠(GB1p, GB1m2, GB1m3, Betanova, LLM)肽。该完全基于序列的模型能够在选择相同的模型参数时,使这些不同的多肽发生折叠。此外,多肽的熔化行为与实验数据在数量上取得了良好的一致。对比使用不同可观测量获得的显著折叠构象的结果发现,对于一些多肽(例如Betanova),其结果非常不同。而在其他情况下(尤其是GB1m2和GB1m3),不同的估计结果相当一致,表明它们具有更类似于二态的熔化行为。

作者:Anders Irb"ack, Sandipan Mohanty

论文ID:q-bio/0412007

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2009-11-10

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中