人类转录组中丰富的A到I编辑位点的系统鉴定
摘要：人体转录组中A-to-I编辑位点的计算搜索 ADAR家族的双链RNA特异性ADAR成员进行的RNA编辑导致特定位点的腺嘌呤转变为肌醇核苷（A-to-I）前体信使RNA。ADAR的编辑被认为在所有后生动物中发生，并且对于哺乳动物的发育至关重要。目前，人类ADAR底物只知道有限数量，而间接证据表明所有预mRNA的相当大部分都会受到影响。在这里，我们描述了一种对人类转录组中ADAR编辑位点进行计算搜索的方法，利用了数百万可用的表达序列。在1637个不同基因中映射了12723个A-to-I编辑位点，估计准确率为95％，将已知编辑位点的数量提高了两个数量级。我们通过验证26个新的底物中的编辑发生来实验证明了我们的方法。人体中的A-to-I编辑主要发生在RNA的非编码区域，通常在Alu重复中。对大量编辑位点的分析表明编辑在控制dsRNA稳定性方面的作用。
作者：Erez Y. Levanon, Eli Eisenberg, Rodrigo Yelin, Sergey Nemzer, Martina Hallegger, Ronen Shemesh, Zipora Y. Fligelman, Avi Shoshan, Sarah R. Pollock, Dan Sztybel, Moshe Olshansky, Gideon Rechavi and Michael F. Jantsch
论文ID：q-bio/0411045
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23