寡核苷酸微阵列上杂交和杂交后行为的吸附模型
摘要:Affymetrix拉丁方块掺杂实验的数据分析表明,寡核苷酸微阵列上特征的测量荧光强度与掺入RNA靶浓度之间存在超半数响应函数的关系,通常被识别为朗格缪尔吸附等温线。此外,在高掺入浓度下,不匹配特征的渐近信号几乎总是低于其配对完美匹配特征。我们调查了一些理论上的杂交吸附模型,并发现它们普遍无法解释完美匹配和不匹配特征之间不同的饱和响应。另一方面,我们发现可以在一个模型中找到一个简单而一致的解释,该模型包括在后杂交洗涤阶段平衡杂交后的部分解离。
作者:C.J. Burden, Y. Pittelkow and S.R.Wilson
论文ID:q-bio/0411005
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-11-10