替代遗传密码中密码子重新分配的统一模型
摘要：在特定基因组中发现了许多改变过的遗传密码，其中一个或多个密码子被重新分配给与规范密码中不同的氨基酸。我们提出了一个模型，将重新分配的四种可能机制统一起来，这是基于重新分配涉及到的获取和失去。失去可以是tRNA或释放因子的删除或失去功能；获取可以是重新分配密码子的新型tRNA的获取，也可以是由于突变或碱基修饰而导致现有tRNA功能的获取。在密码子消失机制中，密码子在重新分配期间从基因组中消失。在其他机制中，密码子不会消失。在模棱两可的中间机制中，获取先于失去；在未分配密码子的机制中，失去先于获取；在补偿性变化机制中，失去和获取同时在群体中传播。我们对获取-失去模型进行了模拟，并证明了这四种机制都是可能的。不同机制的频率受选择强度、重新分配的密码子数量、定向突变压力和选择减小基因组大小的可能性的影响。
作者：Supratim Sengupta and Paul G. Higgs
论文ID：q-bio/0410022
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-07-17