SUMO底物和位点的预测:模式识别与系统发育保守性相结合

摘要:小泛素相关修饰(SUMO)蛋白在真核细胞中广泛表达,在被称为泛素化的结构识别中与底物可逆耦合。两个有趣的问题是1)哺乳动物蛋白组中可能包含多少潜在的SUMO底物,如人类和小鼠,2)给定一个SUMO底物,我们能否识别其泛素化位点?为了回答这两个问题,以往的SUMO底物预测系统主要采用模式识别方法,但这会产生较高的敏感性,同时也会有较多潜在的假阳性。因此,我们利用小鼠和人类之间的系统发生保守性来减少潜在的假阳性数目。

作者:Yu Xue, Fengfeng Zhou, Hualei Lu, Guoliang Chen and Xuebiao Yao

论文ID:q-bio/0409011

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2007-05-23

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