β淀粉样蛋白纤维形成的热力学
摘要：淀粉样纤维是蛋白质的聚集体。它们由一个叫做β-淀粉样蛋白（Aβ）的肽构成，含有41到43个残基，由酶作用裂解一种更大的蛋白质，即淀粉样前体蛋白（APP）。X射线衍射实验表明，这些纤维富含β-结构，而肽的形状在APP的生物活性构象中显示出α-螺旋结构。基于已被证明能够形成与整个Aβ肽类似的纤维结构的17个残基的Aβ12-28淀粉样肽，我们开发了一个现实的纤维形成模型。借助物理论证，并与实验结果一致，假设Aβ12-28单体存在四种可能的状态（即原生α-螺旋构象、β-发夹、球状低能态和未折叠态）。利用这些单体状态，构建了寡聚体（二聚体、四聚体和八聚体）。通过对这些结构的三个单体和各种寡聚体进行简短的、详细的分子动力学（MD）计算，得到了这些结构的能量。利用这些结果在一个简单而现实的模型框架内描述与各种淀粉样构象相关的熵项，可以计算出整个多体系统的相图，从而得到与实验结果整体一致的热力学图像。特别是，胶束亚稳态的存在似乎是决定系统热力学性质的关键问题。
作者：G. Tiana, F. Simona, R. A. Broglia and G. Colombo
论文ID：q-bio/0406029
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-10