开放式质谱搜索算法
摘要:大规模的质谱/质谱肽谱在蛋白质组学实验中生成,需要高效、敏感和特异的算法来识别肽段。在开放质谱搜索算法[OMSSA]中,特异性通过使用显性模型将实验谱与序列进行匹配来计算经典概率分数。在默认阈值下,OMSSA比可比算法从标准蛋白鸡尾酒中匹配更多的光谱。OMSSA旨在搜索大规模的质谱/质谱数据集时更快。
作者:Lewis Y. Geer, Sanford P. Markey, Jeffrey A. Kowalak, Lukas Wagner, Ming Xu, Dawn M. Maynard, Xiaoyu Yang, Wenyao Shi, Stephen H. Bryant
论文ID:q-bio/0406002
分类:Quantitative Methods
分类简称:q-bio.QM
提交时间:2007-05-23