几何和对称性预塑蛋白质的自由能景观

摘要:蛋白质的天然态折叠可以基于几何和对称性的考虑出现一个简单的物理模型。我们展示了链状分子固有的异性、氢键和体积效应所放置的几何和能量约束、以及疏水性足以产生一个自由能量景观,即使对于一个同种聚合物也有宽阔的极小值。这些极小值对应着几乎紧致的结构,包括蛋白质用来容纳它们的天然态折叠的选择。我们的结果为理解球状蛋白质的共同特征提供了一个通用框架。

作者:Trinh Xuan Hoang, Antonio Trovato, Flavio Seno, Jayanth R. Banavar, Amos Maritan

论文ID:q-bio/0405019

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2009-11-10

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