从矢量表示重构蛋白质结构
摘要：蛋白质球状结构的原生态结构接触图可以通过仅仅知道接触图的主特征向量来重建，并提出了一个精确的算法来实现这一目的。我们的算法对于PDBselect25中长度小于等于120的所有221个球状结构得出了唯一的接触图。我们还表明重建的接触图可以准确地重建三维结构。这些结果表明，接触图的主特征向量提供的降维表示等效于蛋白质结构本身。这种表示预计在生物信息学算法中对蛋白质结构比较和对齐提供了一个有用的工具，同时也是向蛋白质结构预测的有希望的中间步骤。
作者：Markus Porto, Ugo Bastolla, H. Eduardo Roman, and Michele Vendruscolo
论文ID：q-bio/0404015
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-10