温度依赖的弹性蛋白样八肽GVG(VPGVG)的构象转变和氢键动力学:分子动力学研究
摘要:弹性蛋白样八肽GVG(VPGVG)的联合实验/理论研究。本文中介绍了对八肽的温度依赖的折叠和解折叠进行全面的分子动力学研究。当前的研究以及实验的对应部分均发现该肽经历了“逆温度转变”,即在310-330 K左右发生折叠现象。此外,还发现了一个在接近水沸点的异常高温下发生的解折叠转变。由于系统尺寸较小,发现了两个宽广的温度区域:“逆温度转变区域”(约为280-320 K)和“解折叠区域”(T > 330 K),在约330 K左右的温度下肽具有最大的折叠概率。该过程涉及一个热力学序参量或反应坐标的详细分子图像,并通过氢键动力学的时间相关函数分析了肽内部以及肽与溶剂化水分子之间的相关性。讨论了与实验证据的相关性以及对弹性蛋白性质的影响。
作者:Roger Rousseau, Eduard Schreiner, Axel Kohlmeyer, and Dominik Marx
论文ID:q-bio/0401012
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-11-10